南京航空航天大学深圳研究院（以下简称“研究院”）是南航在粤港澳大湾区唯一独立举办的专业性创新机构与事业法人单位。研究院依托学校在航空航天领域的深厚学科积累与科研实力，紧密对接深圳市低空经济等战略性新兴产业发展需求，与龙华区政府共建“深圳-南航低空智联产业科技创新中心”，落地“空中交通管理系统全国重点实验室”“高安全系统的软件开发与验证技术工信部重点实验室”“先进飞行器导航、控制与健康管理工信部重点实验室”以及“中小型无人机先进技术工信部重点实验室”四大国家级平台分支机构，已纳入深圳市低空经济产业发展“十五五”规划重点研究机构。

研究院以服务低空经济安全、高效、可持续发展为导向，持续推进低空经济联合创新、低空智联网创新应用、低空交通管理创新三个分中心的实体化建设，聚焦低空智联技术与运行管理、低空飞行空地协同、立体交通仿真验证等技术方向，自主研发“御天”低空飞行服务管理平台、“御星”低空飞行应用管理平台、低空综合起降场管理平台、低空交通仿真验证平台、、“御云”无人机云系统，并具备国家网络安全等级保护二级资质，形成覆盖“规划、管理、运行、验证”全生命周期的低空平台赋能矩阵，并在政务、海事、公安、交警、建筑等重要领域开展示范性应用。

截至2026年8月，研究院累计产出核心知识产权138项、高水平论文200余篇，参与10余项国家及行业标准编制；与深圳市龙华区、深圳海事局、中建三局等10余家单位开展合作，与民航深圳空管站、高德软件、深城交等共建联合创新平台，构建“政产学研用”深度融合的创新生态，荣获深圳市“A级研究院”。